Přehled o publikaci
2022
Variable Stabilisation in Boolean Monotonic Model Pools
PASTVA, SamuelZákladní údaje
Originální název
Variable Stabilisation in Boolean Monotonic Model Pools
Autoři
PASTVA, Samuel
Vydání
Cham, Computational Methods in Systems Biology, od s. 122-137, 16 s. 2022
Nakladatel
Springer
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
elektronická verze "online"
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ne
Organizace
Fakulta informatiky – Masarykova univerzita – Repozitář
ISBN
978-3-031-15033-3
ISSN
UT WoS
Klíčová slova anglicky
boolean network; monotonic function; influence graph
Návaznosti
GA22-10845S, projekt VaV.
Změněno: 2. 4. 2025 00:50, RNDr. Daniel Jakubík
Anotace
V originále
One of the central issues in logical modeling is whether a certain property of the model emerges due to its topological structure (i.e. its influence graph), or due to its dynamical structure (i.e. its logical update functions). In this paper, we practically evaluate a previously proposed formal instrument for studying this question: monotonic model pools and their associated skeleton Boolean networks. Specifically, we propose a simplified over-approximation theorem for skeleton networks and study the emergence of variable stability in these systems. Additionally, we consider the notion of minimal stabilizing interventions and show how to compute such interventions symbolically. We survey the practicality of this methodology on 100+ real-world Boolean networks.