D 2022

Variable Stabilisation in Boolean Monotonic Model Pools

PASTVA, Samuel

Základní údaje

Originální název

Variable Stabilisation in Boolean Monotonic Model Pools

Autoři

PASTVA, Samuel

Vydání

Cham, Computational Methods in Systems Biology, od s. 122-137, 16 s. 2022

Nakladatel

Springer

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

elektronická verze "online"

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizace

Fakulta informatiky – Masarykova univerzita – Repozitář

ISBN

978-3-031-15033-3

ISSN

Klíčová slova anglicky

boolean network; monotonic function; influence graph

Návaznosti

GA22-10845S, projekt VaV.
Změněno: 2. 4. 2025 00:50, RNDr. Daniel Jakubík

Anotace

V originále

One of the central issues in logical modeling is whether a certain property of the model emerges due to its topological structure (i.e. its influence graph), or due to its dynamical structure (i.e. its logical update functions). In this paper, we practically evaluate a previously proposed formal instrument for studying this question: monotonic model pools and their associated skeleton Boolean networks. Specifically, we propose a simplified over-approximation theorem for skeleton networks and study the emergence of variable stability in these systems. Additionally, we consider the notion of minimal stabilizing interventions and show how to compute such interventions symbolically. We survey the practicality of this methodology on 100+ real-world Boolean networks.

Přiložené soubory