Přehled o publikaci
2023
Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue.
REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ et. al.Základní údaje
Originální název
Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue.
Autoři
REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ
Vydání
CEITEC PhD Conference, 2023
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakta
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Organizace
Středoevropský technologický institut – Masarykova univerzita – Repozitář
Klíčová slova anglicky
leukemia; LYmphoid NeXt-Generation Sequencing; LYNX;
Návaznosti
LM2018140, projekt VaV. LX22NPO5102, projekt VaV. NU21-08-00237, projekt VaV. NU22-08-00227, projekt VaV.
Změněno: 25. 3. 2024 03:21, RNDr. Daniel Jakubík
Anotace
V originále
High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemia clinical research', he has been involved in the development of several software projects, e.g.: LYNX (LYmphoid NeXt-Generation Sequencing) analytical software, CLLue, ARResT/Interrogate, ARResT/Subsets aka Encyclopedia of CLL Subsets. LYNX is a tailor-made bioinformatic tool for a new custom-designed capture-based NGS panel. With this tool, a user can analyze molecular markers, such as gene mutations, copy number variations, antigen receptor rearrangements, and translocations in the most common lymphoid malignancies. CLLue is an interactive web-based tool that allows users to perform a visual exploratory data analysis, identification of important and significant features in given groups based on statistical tests, and de novo clustering on their data.
