J 2023

Improved Screening of Monoclonal Gammopathy Patients by MALDI-TOF Mass Spectrometry

PEČINKA, Lukáš; Monika VLACHOVÁ; Lukáš MORÁŇ; Jana GREGOROVÁ; Volodymyr POROKH et al.

Základní údaje

Originální název

Improved Screening of Monoclonal Gammopathy Patients by MALDI-TOF Mass Spectrometry

Autoři

PEČINKA, Lukáš; Monika VLACHOVÁ; Lukáš MORÁŇ; Jana GREGOROVÁ; Volodymyr POROKH; Petra KOVAČOVICOVÁ; Martina ALMÁŠI; Luděk POUR; Martin ŠTORK; Josef HAVEL; Sabina ŠEVČÍKOVÁ a Petr VAŇHARA

Vydání

Journal of the American Society for Mass Spectrometry, WASHINGTON, American Chemical Society, 2023, 1044-0305

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/23:00132350

Organizace

Lékařská fakulta – Masarykova univerzita – Repozitář

EID Scopus

Klíčová slova anglicky

MALDI-TOF mass spectrometry; multiple myeloma; plasma cell leukemia; monoclonal gammopathy; principal component analysis; machine learning; partial least-squares-discriminant analysis; molecular profiling; fingerprinting

Návaznosti

LX22NPO5102, projekt VaV. MUNI/A/1298/2022, interní kód Repo. MUNI/A/1301/2022, interní kód Repo. MUNI/A/1370/2022, interní kód Repo. MUNI/A/1575/2023, interní kód Repo. MUNI/11/ACC/3/2022, interní kód Repo. NU21-03-00076, projekt VaV.
Změněno: 6. 11. 2024 00:50, RNDr. Daniel Jakubík

Anotace

V originále

gt;50×) of mass spectra obtained from extracts of peripheral blood plasma from monoclonal gammopathy patients. When coupled with advanced statistics and machine learning, the mass spectra profiles enabled the direct identification, classification, and discrimination of multiple myeloma and plasma cell leukemia patients with high accuracy and precision. A model based on PLS-DA achieved the best performance with 71.5% accuracy (95% confidence interval, CI = 57.1–83.3%) when the 10× repeated 5-fold CV was performed. In summary, the two-step extraction protocol improved the analysis of monoclonal gammopathy peripheral blood plasma samples by mass spectrometry and provided a tool for addressing the complex molecular etiology of monoclonal gammopathies.

Přiložené soubory