ZAFAR, Hassan and Gabriel DEMO. Liquid-liquid phase separation of a bacterial translation factor. In XXVIIth Biochemistry congress of Czech Society for Biochemistry and Molecular Biology. 2023. ISBN 978-80-8240-047-5.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Liquid-liquid phase separation of a bacterial translation factor
Name in Czech Fázová separace bakteriálního translačního faktoru
Authors ZAFAR, Hassan and Gabriel DEMO.
Edition XXVIIth Biochemistry congress of Czech Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2023.
Other information
Original language English
Type of outcome Konferenční abstrakta
Country of publisher Slovakia
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
Organization Středoevropský technologický institut – Repository – Repository
ISBN 978-80-8240-047-5
Keywords (in Czech) fázova separace; translace; iniciační faktor 2; kondenzát
Keywords in English phase separation; translation; initiation Factor 2; condensate
Links LX22NPO5103, research and development project.
Changed by Changed by: RNDr. Daniel Jakubík, učo 139797. Changed: 15/11/2023 03:33.
Abstract
Compartmentalization is a hallmark of living cells that allows them to perform complex tasks by dynamically coordinating matter and energy fluxes in space and time. This compartmentalization of membrane-less organelles in prokaryotes is driven by Liquid-Liquid Phase Separation (LLPS). Studies have shown LLPS to be a major driving force in the subcellular organization of bacterial cells. These biomolecular condensates are comprised of proteins that are generally rich in intrinsically disordered regions (IDRs). In prokaryotes, translation initiation factor 2 (IF-2) is a GTPase that binds the initiator tRNA and catalyses the ribosomal subunit joining to form the elongation competent 70S complex. A large portion of IF-2 contains IDRs, making the protein a favourable candidate for homotypic and/or heterotypic interactions. Here, we present biochemical evidence that IF-2 can phase separate under specific conditions. The IF-2 LLPS formation can provide deeper insight into compartmentalized translation machinery in bacterial cells.
Abstract (in Czech)
Kompartmentalizace je charakteristickým znakem živých buněk, která jim umožňuje provádět složité úkoly dynamickou koordinací toků hmoty a energie v prostoru a čase. Tato kompartmentalizace bezmembránových organel u prokaryot je řízena separací kapaliny (LLPS). Studie ukázaly, že LLPS je hlavní hnací silou v subcelulární organizaci bakteriálních buněk. Tyto biomolekulární kondenzáty se skládají z proteinů, které jsou obecně bohaté na vnitřní neuspořádané oblasti (IDR). U prokaryot je translační iniciační faktor 2 (IF-2) GTPáza, která váže iniciační tRNA a katalyzuje spojení ribozomálních podjednotek za vzniku elongačního kompetentního komplexu 70S. Velká část IF-2 obsahuje IDR, což z proteinu činí kandidáta na homotypické a/nebo heterotypické interakce. Zde uvádíme biochemický důkaz, že IF-2 se může za specifických podmínek fázově oddělit. Tvorba IF-2 LLPS může poskytnout hlubší pohled na kompartmentalizovaný translační aparát v bakteriálních buňkách.
Type Name Uploaded/Created by Uploaded/Created Rights
CSBMB_poster_final_version_HZ_GD.pdf Licence Creative Commons  File version 11/11/2023

Properties

Name
CSBMB_poster_final_version_HZ_GD.pdf
Address within IS
https://repozitar.cz/auth/repo/58247/1622291/
Address for the users outside IS
https://repozitar.cz/repo/58247/1622291/
Address within Manager
https://repozitar.cz/auth/repo/58247/1622291/?info
Address within Manager for the users outside IS
https://repozitar.cz/repo/58247/1622291/?info
Uploaded/Created
Sat 11/11/2023 03:13

Rights

Right to read
  • anyone on the Internet
Right to upload
 
Right to administer:
  • a concrete person Mgr. Lucie Vařechová, uco 106253
  • a concrete person RNDr. Daniel Jakubík, uco 139797
  • a concrete person Mgr. Jolana Surýnková, uco 220973
  • a concrete person Mgr. Michal Maňas, uco 2481
Attributes
 
Print
Add to clipboard Displayed: 19/5/2024 15:18