Přehled o publikaci
2022
Hairy root transformation system as a tool for CRISPR/Cas9-directed genome editing in oilseed rape (Brassica napus)
JEDLIČKOVÁ, Veronika; Kateřina MÁCOVÁ; Marie ŠTEFKOVÁ; Jan BUTULA; Jana ZEMÁNKOVÁ et al.Základní údaje
Originální název
Hairy root transformation system as a tool for CRISPR/Cas9-directed genome editing in oilseed rape (Brassica napus)
Autoři
JEDLIČKOVÁ, Veronika; Kateřina MÁCOVÁ; Marie ŠTEFKOVÁ; Jan BUTULA; Jana ZEMÁNKOVÁ; Marek SEDLÁČEK a Helene ROBERT BOISIVON
Vydání
Frontiers in Plant Science, SWITZERLAND, Frontiers Research Foundation, 2022, 1664-462X
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Stát vydavatele
Švýcarsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14740/22:00126354
Organizace
Středoevropský technologický institut – Masarykova univerzita – Repozitář
UT WoS
EID Scopus
Klíčová slova anglicky
hairy root; CRISPR/Cas9; genome-editing; Brassica napus; TAA1
Návaznosti
EF16_026/0008446, projekt VaV. GA19-05200S, projekt VaV. Czech-BioImaging II, velká výzkumná infrastruktura.
Změněno: 9. 10. 2024 00:50, RNDr. Daniel Jakubík
Anotace
V originále
Our study examined the mutation efficiency of the CRISPR/Cas9 method for tryptophan aminotransferase BnaTAA1 genes involved in the auxin biosynthesis pathway. We made nine CRISPR/Cas9 constructs with various promoters driving the expression of a Cas9 from Staphylococcus aureus (SaCas9) or a plant-codon-optimized Streptococcus pyogenes Cas9 (pcoCas9). We developed a fast and efficient system for evaluating the variety and frequency of mutations caused by each construct using Brassica napus hairy roots. We showed that pcoCas9 is more efficient in mutating the targeted loci than SaCas9 and the presence of the NLS signal enhanced the chance of mutagenesis by 25%. The mutations were studied further in regenerated lines, and we determined the BnaTAA1 gene expression and heritability of the gene modifications in transgenic plants. Hairy root transformation combined with CRISPR/Cas9-mediated gene editing represents a fast and straightforward system for studying target gene function in the important oilseed crop B. napus.