a 2023

Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue.

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue.

Autoři

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ

Vydání

CEITEC PhD Conference, 2023

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakta

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Organizace

Středoevropský technologický institut – Masarykova univerzita – Repozitář

Klíčová slova anglicky

leukemia; LYmphoid NeXt-Generation Sequencing; LYNX;

Návaznosti

LM2018140, projekt VaV. LX22NPO5102, projekt VaV. NU21-08-00237, projekt VaV. NU22-08-00227, projekt VaV.
Změněno: 25. 3. 2024 03:21, RNDr. Daniel Jakubík

Anotace

V originále

High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemia clinical research', he has been involved in the development of several software projects, e.g.: LYNX (LYmphoid NeXt-Generation Sequencing) analytical software, CLLue, ARResT/Interrogate, ARResT/Subsets aka Encyclopedia of CLL Subsets. LYNX is a tailor-made bioinformatic tool for a new custom-designed capture-based NGS panel. With this tool, a user can analyze molecular markers, such as gene mutations, copy number variations, antigen receptor rearrangements, and translocations in the most common lymphoid malignancies. CLLue is an interactive web-based tool that allows users to perform a visual exploratory data analysis, identification of important and significant features in given groups based on statistical tests, and de novo clustering on their data.
Zobrazeno: 14. 6. 2025 22:55